该所司法精神病鉴定工作始于1953年，为国内之先，1980年在全国率先正式建立了司法精神病科，业务能力范围主要是对刑事罪犯、受害人或民事行为当事人的精神状态作出评价，并确定其实施危害行为时的责任能力、受审能力、服刑能力等、民事行为能力和精神损伤鉴定。鉴定活动遵循相应的法律、法规和规章，独立、客观、公正地进行，实行鉴定人负责制度。

该所是经江苏省司法厅批准成立的具有独立法人资格的司法鉴定机构，目前开展法医临床鉴定项目。 该所现有执业司法鉴定人6人，鉴定人助理3人，其中具有高级职称4人，有博士学位2人，硕士学位1人，本科4人，大专1人，中专1人。目前接受全国公、检、法、司等机关以及企事业单位、社会团体和个人的委托，对诉讼、仲裁等活动中所涉及的法医临床类的专门性问题进行检验、鉴别和判定。

该所是经省司法厅核准的具有独立法人地位的第三方司法鉴定机构，是从事法医学司法鉴定的专业机构。 该所依托法医学会和同仁医院的雄厚实力，拥有一流专家团队，鉴定人具多年法医学实践，具有丰富实践经验。

该所是2009年9月经江苏省司法厅许可成立的南京市江北地区第一家法医临床学司法鉴定所。该所有11名司法鉴定人，具有高级技术职称7名、中级技术职称3名、初级技术职称1名；其中2名司法鉴定人是具有高级技术职称，且已从事法医工作数十年的专业人员。 该所母体单位是南京江北人民医院（原中国石化集团南化公司医院），是南京江北地区规模最大、技术力量最强、功能最齐全的综合性三级医院。具有鉴定工作需要的核磁共振、电测听及脑干诱发电位仪等检查设备。

南京金陵司法鉴定所于2006年成立，鉴定业务范围有法医临床鉴定、法医病理鉴定、医疗损害鉴定、文书鉴定、痕迹鉴定等。 南京金陵司法鉴定所拥有共聚焦显微拉曼光谱仪、文痕检仪、神经电检诊仪、生物显微镜系统、金相显微镜系统、比较显微镜、体式显微镜、荧光显微镜、全套病理设备等各类中大型仪器30余台；全所现有工作人员四十四人，其中司法鉴定人二十九人，副高以上职称的鉴定人十八人，还聘请了包括医学临床各科主任、副主任医师等近七十人的外部专家团队。历年来出具的鉴定意见被法院、仲裁等机关广泛采纳，其中多例案件被中央电视台、各级媒体广泛报道，获得良好社会影响和评价。 2009年南京金陵司法鉴定所先后通过了中国合格评定国家认可委员会的认可和中国国家认证认可监督管理委员会资质认定，并相继获得《CNAS检查机构认可证书》和《资质认定审查认可证书》，成为江苏省首家全项通过CNAS认可的综合性司法鉴定机构。 自2008年以来，金陵所在参加司法部组织的能力验证满意通过率达96%；在全国优秀司法鉴定文书评选活动中连续获奖，其中“鼎永杯”二等奖、三等奖各一次，“宋慈杯”二等奖、三等奖各一次。

南京东南司法鉴定中心是经江苏省司法厅批准成立，受南京市司法局直接管理具有独立法人资格的综合性司法鉴定机构，通过国家认证认可和国家司法鉴定机构资质认定的权威鉴定机构，主要从事文书、痕迹、法医临床、法医病理、法医物证（各类亲子鉴定、个体识别）、法医毒化（包括酒精测试）、微量物证、心理测试、电子数据等司法鉴定实践及理论研究工作。中心拥有现代化仪器设备和办公场所，高技术职称和高学历人才优势明显。多年来，中心一直秉承“公正科学、及时准确、以法律己、优质服务”的质量方针，持续不断地为诉讼、仲裁等领域的当事人提供全面的专业问题解决方案。