南京东南司法鉴定中心是经江苏省司法厅批准成立，受南京市司法局直接管理具有独立法人资格的综合性司法鉴定机构，通过国家认证认可和国家司法鉴定机构资质认定的权威鉴定机构，主要从事文书、痕迹、法医临床、法医病理、法医物证（各类亲子鉴定、个体识别）、法医毒化（包括酒精测试）、微量物证、心理测试、电子数据等司法鉴定实践及理论研究工作。中心拥有现代化仪器设备和办公场所，高技术职称和高学历人才优势明显。多年来，中心一直秉承“公正科学、及时准确、以法律己、优质服务”的质量方针，持续不断地为诉讼、仲裁等领域的当事人提供全面的专业问题解决方案。

南京金陵司法鉴定所于2006年成立，鉴定业务范围有法医临床鉴定、法医病理鉴定、医疗损害鉴定、文书鉴定、痕迹鉴定等。 南京金陵司法鉴定所拥有共聚焦显微拉曼光谱仪、文痕检仪、神经电检诊仪、生物显微镜系统、金相显微镜系统、比较显微镜、体式显微镜、荧光显微镜、全套病理设备等各类中大型仪器30余台；全所现有工作人员四十四人，其中司法鉴定人二十九人，副高以上职称的鉴定人十八人，还聘请了包括医学临床各科主任、副主任医师等近七十人的外部专家团队。历年来出具的鉴定意见被法院、仲裁等机关广泛采纳，其中多例案件被中央电视台、各级媒体广泛报道，获得良好社会影响和评价。 2009年南京金陵司法鉴定所先后通过了中国合格评定国家认可委员会的认可和中国国家认证认可监督管理委员会资质认定，并相继获得《CNAS检查机构认可证书》和《资质认定审查认可证书》，成为江苏省首家全项通过CNAS认可的综合性司法鉴定机构。 自2008年以来，金陵所在参加司法部组织的能力验证满意通过率达96%；在全国优秀司法鉴定文书评选活动中连续获奖，其中“鼎永杯”二等奖、三等奖各一次，“宋慈杯”二等奖、三等奖各一次。

南京康宁司法鉴定中心是经江苏省司法厅批准，依法设立具有独立法人资格的司法鉴定机构（司法鉴定许可证号：320114021），是独立于公检法系统之外的第三方鉴定机构，鉴定结论具有法律效力，为公检法司所认可。目前已核定开展的鉴定业务有：法医临床鉴定、法医病理鉴定、法医毒物鉴定、法医物证鉴定、文书鉴定、痕迹鉴定，声像资料鉴定、电子数据鉴定。其中DNA（亲子鉴定、亲权鉴定等）、笔迹、指纹、道路交通事故技术、声纹统一性、语音资料和录音文件的分析处理及真实性、视频图像的分析处理及原始性和真实性、电子数据恢复、文件一致性等鉴定位居行业前沿领域。

该所依托医科大学的雄厚技术资源和人才优势，于2002年6月经江苏省司法厅批准正式成立的社会鉴定机构，并由最高人民法院向全国公示，其前身是南京医科大学法医学教研室，早在上世纪五十年代就开始从事法医鉴定工作。2005年3月在原有“南京医科大学司法鉴定所”基础上挂牌增设“江苏省妇女伤情鉴定中心”，2013年获得“江苏省司法鉴定先进集体”称号；2016年获得司法部司法鉴定管理局第二届“宋慈杯”优秀奖2；019年获得“全国公共法律服务工作先进集体”称号。 该所现有专业司法鉴定人22名，其中法医病理类鉴定人14名、法医临床类鉴定人15名、法医物证类鉴定人6名，具有高级职称11名，研究生以上学历的占54.5%；下设法医生物学实验室、解剖室、法医病理实验室、法医临床实验室（电生理检测等）、法医毒物实验室五个实验室，拥有专业检查、检测仪器（3130型全自动遗传分析仪、图像分析系统、视听觉电生理系统等、液相色谱质谱联用仪、顶空气相色谱仪、气相色谱质谱联用仪），总资产达800余万元。

南京正泓司法鉴定所于2014年5月经江苏省司法厅审核批准成立，是独立法人性质的专业法医类司法鉴定机构（统一社会信用代码：343200003025353937；资质认定证书编号：181007030390），由江苏省司法厅统一编入江苏省《国家司法鉴定人和司法鉴定机构名册》，并纳入江苏省最高人民法院司法鉴定机构平台，向社会公告。 鉴定所秉承“笃诚、唯公、察微、见真”的价值理念，面向社会接受各级司法机关、仲裁机构、社会法人、其他组织以及个人的委托，从事法医病理、法医临床有关问题的司法鉴定和技术咨询，致力于为案（事）件诉讼、仲裁、依法处理提供公平、公正、客观、严谨的科学证据。

该所是2009年9月经江苏省司法厅许可成立的南京市江北地区第一家法医临床学司法鉴定所。该所有11名司法鉴定人，具有高级技术职称7名、中级技术职称3名、初级技术职称1名；其中2名司法鉴定人是具有高级技术职称，且已从事法医工作数十年的专业人员。 该所母体单位是南京江北人民医院（原中国石化集团南化公司医院），是南京江北地区规模最大、技术力量最强、功能最齐全的综合性三级医院。具有鉴定工作需要的核磁共振、电测听及脑干诱发电位仪等检查设备。

江苏省人民医院司法鉴定所为2005年首批成立的司法鉴定机构，分设法医物证（亲权鉴定）和法医临床两个专业。已取得中国国家认证认可监督管理委员会颁发的资质认定证书（CMA）、中国合格评定国家认可委员会颁发的实验室认可证书(CNAS),是通过国家级评定的鉴定机构，鉴定意见书国际互认。亲权鉴定工作始于2000年，是江苏省最早应用DNA-STR技术进行亲权鉴定的实验室。目前已完成鉴定案例2万例以上，为省内亲权鉴定工作的重点单位。是江苏省法医物证专业委员会主任委员单位、南京市司法鉴定协会副会长和秘书长单位。

该所是经省司法厅核准的具有独立法人地位的第三方司法鉴定机构，是从事法医学司法鉴定的专业机构。 该所依托法医学会和同仁医院的雄厚实力，拥有一流专家团队，鉴定人具多年法医学实践，具有丰富实践经验。

该所经江苏省司法厅批准，于2006年11月成立，并依托建院有20年历史、集医疗、教学、科研为一体的南京金陵中西医结合医院（原南京金陵男科医院），拥有性功能障碍实验室、性功能特检室、夜间阴茎勃起监测（NPT）室、彩色多普勒超声波室、临床检验中心等科室，按照司法部《司法鉴定机构仪器设备配置标准》要求配置全套性功能障碍实验室特殊检测仪器，专业从事男性性功能鉴定，为道路交通事故、职工工伤、人身伤害、医疗纠纷、婚姻纠纷、涉嫌性侵害等案件中涉及性功能的问题提供法律依据。

江苏苏博检测技术有限公司司法鉴定所于2018年11月28日经江苏省司法厅批准依法设立，是面向社会服务的专门从事司法鉴定的机构，本机构致力于为政府、执法及行政管理机构提供公正、准确的司法鉴定数据，并为公、检、法、司各界所认可。本机构业务范围为法医毒物鉴定，主要包括血液中乙醇及其代谢物的测定，毒品鉴定，生物检材毒品鉴定，体内滥用药物的检验，常见毒、药物定性定量分析等专业的司法鉴定技术服务。 本机构坐落在南京市江北新区中丹生命科学产业园，占地面积700多平方米，基础设施完备，技术实力雄厚，现有仪器设备30余台(套)，主要有液质联用仪、气质联用仪、气相色谱仪、液相色谱仪、电感耦合等离子质谱仪、原子吸收光谱仪等。本所现有五名专职司法鉴定人，并拥有长期从事司法鉴定管理工作的技术和管理人才，同时，具有丰富的司法鉴定从业背景，能够为客户提供多方位的司法鉴定技术服务。

该所是经江苏省司法厅批准成立的具有独立法人资格的司法鉴定机构，目前开展法医临床鉴定项目。 该所现有执业司法鉴定人6人，鉴定人助理3人，其中具有高级职称4人，有博士学位2人，硕士学位1人，本科4人，大专1人，中专1人。目前接受全国公、检、法、司等机关以及企事业单位、社会团体和个人的委托，对诉讼、仲裁等活动中所涉及的法医临床类的专门性问题进行检验、鉴别和判定。

南京红十字血液中心司法鉴定所是2005年经江苏省司法厅首批审核批准设立的江苏省第一家司法鉴定所。司法鉴定所建有设备先进的分子生物学实验室，业务范围为法医物证鉴定（亲权鉴定）。从90年代开始通过血型检验技术进行亲子鉴定并多次为司法鉴定咨询提供服务，到2000年以后建立以DNA测序为基础的STR方法，司法鉴定所开展亲子鉴定工作已有近二十年历史。