该所是隶属于南通市精神卫生中心的独立机构，其前身是经江苏省人民政府批准设立的南通市精神疾病司法鉴定委员会。南通市精神卫生中心自1969年建院伊始即开展精神疾病司法鉴定业务，几十年来，该中心秉承独立、公正、客观、科学、对法律高度负责的精神，规范管理，依法鉴定，司法鉴定质量得到广泛好评，在同行业中颇有声誉。 经过多年的发展，该中心司法鉴定所鉴定设备齐全、技术力量雄厚、管理规范科学，鉴定工作制度化，文书出具规范化，档案管理正规化，整个鉴定活动形成一整套完整有效的管理体系，从而确保了鉴定活动的高质量和高满意度。 该所始终注重自身业务能力的不断提高，积极鼓励撰写论文和开展科研活动，司法鉴定所每年均派遣2～3名专家参加全国各地的司法鉴定学术交流，每年均有数篇专业论文发表，鉴定所开展的“二项迫选数字应用于司法鉴定的抗伪装研究”科研课题于2007年获南通市卫生局新技术课题奖。

该所是隶属于启东市人民医院，面向社会服务的非独立法人机构。启东市人民医院是启东唯一一所集医疗、教学、科研、急救为一体的三级综合性医院，以雄厚的实力为该所司法鉴定工作的开展提供了强有力的硬件保障。目前医院拥有1.5T高场磁共振机、40层螺旋CT、X线数字减影成像系统（简称DSA），DR/CRX线摄片机、体外高频热疗机、日立7170/7180全自动生化仪、高压氧舱、腹腔镜、胆道镜、宫腔镜、阴道镜、超细电子胃镜、电子肠镜等大中型现代化设备100多件，同时医院还设置有现代化的检验中心。启东市人民医院在现代化医院的建设过程中，大力实施“人才兴院”和创名院、建名科、树名医的“三名”战略，以“以人为本”的服务理念，坚持“以病人为中心，提高医疗服务质量”为主题开展医院管理年活动，努力构建和谐医院，促进和谐社会，鉴定所成立于2006年，现有13位司法鉴定人，已完成鉴定数千余人次。

该所位于如东县掘港镇江海西路2号，实验室面积150平方米，本所符合《关于司法鉴定管理问题的决定》规定的条件于2006年8月24日准予登记，由江苏省司法厅颁证。 目前业务范围：法医临床（一般活体鉴定，听觉功能鉴定，视觉功能鉴定）。该所获得由江苏省质量监督局颁发的资质认定计量认证证书。全所有13名工作人员，其中高级职称10人，中级职称2人，初级职称1人。 该所2011年-2013年度本所获得“江苏省司法鉴定机构规范化建设先进集体”，2014年-2015年获得“南通市司法鉴定工作先进集体”，2012年获得全国第二届《鼎永杯优秀鉴定文书》三等奖。 本所严格遵守国家相关法律法规的规定，遵循客观独立、公平公正、诚实信用原则，恪守职业道德，承担社会责任。