江苏省理化测试中心司法鉴定所是依托江苏省理化测试中心成立的司法鉴定机构，是南京市司法鉴定协会环境损害和理化专委会主任委员单位。机构于2012年8月正式获得司法厅颁发的司法鉴定许可证，许可范围：微量物证鉴定、环境损害鉴定（环境污染物性质鉴定（危险废物鉴定、有毒物质鉴定、污染物物理化学性质鉴定））。 　　司鉴所质量管理体系健全，目前获得检验检测机构资质认定（CMA）的检测项目约2600项，获得中国合格评定国家认可委员会实验室认可（CNAS）的检测项目约300项，主要涉及食品、环境、药品、化工等领域检测能力。 　　司鉴所承接的“涉案检材中罂粟碱、吗啡、那可丁、可待因和蒂巴因含量的鉴定”、“‘隆源村枣夹核桃仁’产品中脂肪含量的鉴定案”、“对承揽合同纠纷所涉设备进水出水水样COD含量进行微量物质物证鉴定案”等多个意见书被评为“江苏省优秀司法鉴定文书”，并收录在司法部司法行政案例库中。2017年司鉴所1人被南京市司法局评为“南京市首届十佳司法鉴定人”。

南京东南司法鉴定中心是经江苏省司法厅批准成立，受南京市司法局直接管理具有独立法人资格的综合性司法鉴定机构，通过国家认证认可和国家司法鉴定机构资质认定的权威鉴定机构，主要从事文书、痕迹、法医临床、法医病理、法医物证（各类亲子鉴定、个体识别）、法医毒化（包括酒精测试）、微量物证、心理测试、电子数据等司法鉴定实践及理论研究工作。中心拥有现代化仪器设备和办公场所，高技术职称和高学历人才优势明显。多年来，中心一直秉承“公正科学、及时准确、以法律己、优质服务”的质量方针，持续不断地为诉讼、仲裁等领域的当事人提供全面的专业问题解决方案。

江苏省建筑工程质量检测中心有限公司司法鉴定所，成立于2010年，位于南京市栖霞区。