豢养的家畜的亲子鉴定：比如有两头母牛和一头小牛，要求鉴定哪头母牛才是小牛的真正母亲?或者鉴定这头小牛是不是这头母牛所生?这些都是鉴定家畜的案例，由于在一个村子或者是一个镇，通常都只有一头公牛或者叫种牛，只能通过母牛和小牛的共有特征来进行鉴别。 　　克隆动物的鉴定：对克隆动物进行鉴定，被克隆出来的动物和提供体细胞用来克隆它的动物应该在DNA结构方面完全一致，鉴定过程中，就要必须确定此动物确系父系的体细胞的克隆而来。 　　各种名贵动物的血缘鉴定：以确定它们的血缘或种系。如对某些名贵狗进行DNA鉴定，这样可以更加确切地知道他们真正的血缘关系。还有其它一些对种系要求非常严格的动物，都需要进行DNA鉴定，以确定它们的真正血缘。