该所是隶属于淮安市第三人民医院的非独立法人机构，其前身是经江苏省人民政府批准设立的淮安市精神疾病司法鉴定委员会。2010年4月6日经江苏省司法厅核准成立淮安市第三人民医院司法鉴定所。《司法鉴定许可证》证号320810011。 淮安市第三人民医院前身是淮阴地区神经精神病防治院。自1969年建院伊始即开展精神疾病司法鉴定业务。几十年来，该院司法鉴定秉承独立、公正、客观、科学、对法律高度负责的精神，规范管理、依法鉴定，司法鉴定质量得到广泛好评，在同行业中颇有声誉。 目前该院司法鉴定所鉴定设备齐全，技术力量雄厚，管理规范科学，鉴定工作制度化，文书出具规范化，档案管理规范化，整个鉴定活动形成一整套完整有效的管理体系，从而确保了鉴定工作的高质量和高满意度。